Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Taf1bP97358 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Taf1bP97358 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Taf1bP97358 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Taf1bP97358 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Taf1bP97358 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Taf1bP97358 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Taf1bP97358 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Taf1bP97358 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Taf1bP97358 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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