Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx1P80205 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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