Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Acta1P68134 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms