Protein–RNA interactions for Protein: P63139

Nfyb, Nuclear transcription factor Y subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfybP63139 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NfybP63139 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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NfybP63139 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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NfybP63139 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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NfybP63139 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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NfybP63139 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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NfybP63139 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms