Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UbdP63072 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms