Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps18P62270 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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