Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vbp1P61759 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vbp1P61759 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Vbp1P61759 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Vbp1P61759 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Vbp1P61759 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Vbp1P61759 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Vbp1P61759 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Vbp1P61759 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Vbp1P61759 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vbp1P61759 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vbp1P61759 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Vbp1P61759 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Vbp1P61759 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vbp1P61759 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Vbp1P61759 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vbp1P61759 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vbp1P61759 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vbp1P61759 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Vbp1P61759 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Vbp1P61759 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vbp1P61759 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vbp1P61759 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vbp1P61759 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vbp1P61759 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vbp1P61759 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vbp1P61759 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vbp1P61759 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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