Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P58686 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P58686 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms