Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Irf5P56477 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Irf5P56477 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Irf5P56477 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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Irf5P56477 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Irf5P56477 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Irf5P56477 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Irf5P56477 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Irf5P56477 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Irf5P56477 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Irf5P56477 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf5P56477 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Irf5P56477 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf5P56477 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf5P56477 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf5P56477 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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