Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Defb1P56386 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Zfp275-202ENSMUST00000114499 6284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Zbtb26-201ENSMUST00000067043 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Defb1P56386 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Defb1P56386 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Defb1P56386 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Defb1P56386 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Defb1P56386 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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Defb1P56386 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Defb1P56386 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Ncoa3-201ENSMUST00000088095 7531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Defb1P56386 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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