Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
GferP56213 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
GferP56213 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
GferP56213 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
GferP56213 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GferP56213 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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