Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Cxcl5P50228 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Cxcl5P50228 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Cxcl5P50228 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Cxcl5P50228 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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