Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TgfaP48030 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TgfaP48030 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TgfaP48030 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TgfaP48030 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TgfaP48030 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TgfaP48030 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TgfaP48030 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
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