Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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