Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtlP38585 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms