Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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TpoP35419 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpoP35419 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TpoP35419 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TpoP35419 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TpoP35419 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TpoP35419 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TpoP35419 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TpoP35419 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TpoP35419 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TpoP35419 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TpoP35419 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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TpoP35419 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TpoP35419 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TpoP35419 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TpoP35419 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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TpoP35419 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TpoP35419 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TpoP35419 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TpoP35419 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TpoP35419 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TpoP35419 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TpoP35419 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TpoP35419 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TpoP35419 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TpoP35419 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TpoP35419 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TpoP35419 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TpoP35419 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TpoP35419 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TpoP35419 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TpoP35419 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TpoP35419 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TpoP35419 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TpoP35419 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TpoP35419 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TpoP35419 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TpoP35419 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TpoP35419 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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TpoP35419 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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TpoP35419 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms