Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms