Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprmP28828 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprmP28828 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprmP28828 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprmP28828 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprmP28828 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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