Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms