Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RxraP28700 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RxraP28700 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RxraP28700 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RxraP28700 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RxraP28700 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RxraP28700 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RxraP28700 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
RxraP28700 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RxraP28700 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RxraP28700 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RxraP28700 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
RxraP28700 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RxraP28700 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RxraP28700 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RxraP28700 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RxraP28700 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RxraP28700 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RxraP28700 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RxraP28700 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RxraP28700 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RxraP28700 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RxraP28700 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RxraP28700 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RxraP28700 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RxraP28700 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
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