Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Hoxd10P28359 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Hoxd10P28359 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Hoxd10P28359 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Hoxd10P28359 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Hoxd10P28359 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Hoxd10P28359 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Hoxd10P28359 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Hoxd10P28359 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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Hoxd10P28359 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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