Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Defa2P28309 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Defa2P28309 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa2P28309 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Defa2P28309 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa2P28309 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa2P28309 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa2P28309 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa2P28309 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Defa2P28309 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa2P28309 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa2P28309 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa2P28309 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa2P28309 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa2P28309 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa2P28309 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa2P28309 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa2P28309 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.79□□□□□ -1
Defa2P28309 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa2P28309 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa2P28309 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa2P28309 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa2P28309 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa2P28309 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa2P28309 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa2P28309 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Defa2P28309 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Defa2P28309 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa2P28309 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa2P28309 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Defa2P28309 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa2P28309 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Defa2P28309 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Defa2P28309 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Defa2P28309 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
Defa2P28309 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Defa2P28309 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms