Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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PdgfraP26618 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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PdgfraP26618 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
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PdgfraP26618 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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PdgfraP26618 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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PdgfraP26618 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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PdgfraP26618 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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PdgfraP26618 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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