Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb9P20615 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb9P20615 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb9P20615 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb9P20615 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb9P20615 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb9P20615 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb9P20615 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb9P20615 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb9P20615 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb9P20615 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb9P20615 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms