Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms