Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P20040 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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