Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NefhP19246 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NefhP19246 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NefhP19246 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NefhP19246 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NefhP19246 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NefhP19246 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NefhP19246 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NefhP19246 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NefhP19246 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NefhP19246 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NefhP19246 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NefhP19246 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NefhP19246 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NefhP19246 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NefhP19246 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NefhP19246 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NefhP19246 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NefhP19246 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NefhP19246 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NefhP19246 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NefhP19246 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NefhP19246 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NefhP19246 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NefhP19246 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NefhP19246 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NefhP19246 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NefhP19246 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NefhP19246 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NefhP19246 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NefhP19246 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NefhP19246 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NefhP19246 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NefhP19246 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NefhP19246 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NefhP19246 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NefhP19246 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NefhP19246 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NefhP19246 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NefhP19246 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NefhP19246 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NefhP19246 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NefhP19246 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NefhP19246 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NefhP19246 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NefhP19246 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NefhP19246 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NefhP19246 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NefhP19246 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NefhP19246 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NefhP19246 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NefhP19246 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NefhP19246 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NefhP19246 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NefhP19246 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NefhP19246 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NefhP19246 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NefhP19246 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NefhP19246 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NefhP19246 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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