Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
DmdP11531 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
DmdP11531 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DmdP11531 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
DmdP11531 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
DmdP11531 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
DmdP11531 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
DmdP11531 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
DmdP11531 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
DmdP11531 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
DmdP11531 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
DmdP11531 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
DmdP11531 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
DmdP11531 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
DmdP11531 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms