Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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H2-Ab1P01921 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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H2-Ab1P01921 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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