Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms