Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Clk2O35491 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Clk2O35491 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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