Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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Prrt1O35449 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Prrt1O35449 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Prrt1O35449 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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