Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smad6O35182 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smad6O35182 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms