Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Usp35M0QWN7 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Usp35M0QWN7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Usp35M0QWN7 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Usp35M0QWN7 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Usp35M0QWN7 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usp35M0QWN7 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usp35M0QWN7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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