Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Cyp1a1-201ENSMUST00000034865 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Hhex-202ENSMUST00000128184 1435 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Trim39-205ENSMUST00000173369 2914 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Zmynd8-204ENSMUST00000109262 2515 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm5046-201ENSMUST00000100608 611 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 E330017L17Rik-204ENSMUST00000145196 876 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm16199-201ENSMUST00000160032 288 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm18560-201ENSMUST00000173463 1123 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm18861-201ENSMUST00000202509 1186 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm8143-201ENSMUST00000203654 1186 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 2900024D18Rik-201ENSMUST00000220700 569 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Epdr1-203ENSMUST00000220944 563 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 AC122937.1-201ENSMUST00000226405 793 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Psors1c2-201ENSMUST00000025273 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Smok3c-202ENSMUST00000178402 1515 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Cd200r4-203ENSMUST00000176819 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 E2f7-204ENSMUST00000173471 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms