Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms