Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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