Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Gm20830J3KML6 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Gm20830J3KML6 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
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Gm20830J3KML6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Gm20830J3KML6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Gm20830J3KML6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Gm20830J3KML6 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
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Gm20830J3KML6 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
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Gm20830J3KML6 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Gm20830J3KML6 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Gm20830J3KML6 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Gm20830J3KML6 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Gm20830J3KML6 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Gm20830J3KML6 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20830J3KML6 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
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