Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Zfp408H7BX78 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Zfp408H7BX78 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Zfp408H7BX78 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp408H7BX78 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Zfp408H7BX78 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp408H7BX78 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp408H7BX78 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp408H7BX78 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp408H7BX78 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Zfp408H7BX78 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Zfp408H7BX78 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp408H7BX78 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp408H7BX78 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp408H7BX78 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp408H7BX78 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp408H7BX78 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp408H7BX78 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp408H7BX78 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp408H7BX78 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp408H7BX78 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Zfp408H7BX78 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp408H7BX78 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp408H7BX78 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp408H7BX78 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp408H7BX78 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp408H7BX78 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp408H7BX78 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp408H7BX78 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp408H7BX78 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp408H7BX78 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp408H7BX78 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp408H7BX78 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp408H7BX78 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp408H7BX78 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp408H7BX78 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp408H7BX78 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp408H7BX78 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp408H7BX78 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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