Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Farp1F8VPU2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms