Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.4 ms