Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms