Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms