Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
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