Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms