Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms