Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 C430039J01Rik-201ENSMUST00000205973 957 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms