Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Cldn34dA2AGU5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms