Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Pramef6A2A8M8 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Pramef6A2A8M8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Pramef6A2A8M8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Pramef6A2A8M8 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms