Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms